Dans le même univers, plusieurs années après les événements de Gravity Circuit, dans une Kernel City reconstruite, les joueurs devront affronter un nouvel Ark rempli de forces d’invasion issues de l’Armée des Chasseurs. Gravity Circuit 2 voit le retour de Kai en tant que personnage jouable, tout en introduisant un nouveau venu : Cable. Les joueurs pourront ainsi passer de l’un à l’autre avant le début d’une nouvelle mission pour découvrir un tout nouveau style de combat quand bon leur semble.
Alors que Kai conserve son style de combat classique au corps à corps, Cable adopte une approche à plus longue portée, avec des projectiles, des sauts multiples capables d’infliger des dégâts aux ennemis et des pouvoirs qui lui permettent de transformer les adversaires vaincus en ferraille pouvant servir de munitions.
